272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43041 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_43041  predicted protein  100 
 
 
383 aa  795    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39554  alpha-ketoglutarate catabolism dioxygenase  69.74 
 
 
386 aa  511  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.470371 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34605  Fe(II)-dependent sulfonate/alpha-ketoglutarate dioxygenase-like protein  65.86 
 
 
385 aa  482  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53191  predicted protein  60.06 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02200  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_8G02210)  49.7 
 
 
383 aa  340  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000205644  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02960  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G07960)  49.08 
 
 
384 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33987  predicted protein  43.99 
 
 
432 aa  284  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08579  conserved hypothetical protein  47.12 
 
 
429 aa  278  8e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214725 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  44 
 
 
363 aa  272  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06739  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_7G06030)  41.25 
 
 
376 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.303982  normal  0.0570192 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29419  predicted protein  43.02 
 
 
420 aa  267  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106431 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05350  conserved hypothetical protein  33.14 
 
 
375 aa  199  9e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01960  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 
432 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02180  sulfonate dioxygenase, putative  36.01 
 
 
388 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28893  predicted protein  36.22 
 
 
412 aa  189  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30111  taurine catabolism dioxygenase  36.65 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51444  taurine catabolism dioxygenase  34.5 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.353625  normal  0.08977 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04111  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G01010)  33.33 
 
 
381 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06800  taurine dioxygenase, putative  35.22 
 
 
376 aa  159  7e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  33.69 
 
 
271 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  31.14 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  33.68 
 
 
277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  35.36 
 
 
270 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11090  TfdA family taurine dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17170)  30.9 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  34.04 
 
 
295 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  32.76 
 
 
282 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  33.1 
 
 
277 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  32.99 
 
 
277 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  31.96 
 
 
277 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  34.64 
 
 
289 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  30.58 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  30.7 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  32.65 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  33.45 
 
 
281 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  30.58 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  32.49 
 
 
312 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
283 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  30.58 
 
 
304 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  32.08 
 
 
297 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  33.68 
 
 
318 aa  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  32.52 
 
 
285 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  32.06 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4724  taurine dioxygenase  31.1 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  32.07 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  33.45 
 
 
290 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  33.58 
 
 
293 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  33.21 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  31.62 
 
 
277 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  31.47 
 
 
280 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  31.16 
 
 
301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  31.86 
 
 
315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  33.92 
 
 
304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  31.12 
 
 
277 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  31.19 
 
 
315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  31.36 
 
 
315 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  31.82 
 
 
315 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21870  taurine catabolism dioxygenase, TauD/TfdA family  31.42 
 
 
287 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  32.74 
 
 
267 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  30.93 
 
 
291 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  28.87 
 
 
283 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  31.19 
 
 
315 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  31.19 
 
 
315 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  31.08 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  33.94 
 
 
272 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03570  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02500  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  28.96 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  31.83 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  29.93 
 
 
292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  31.58 
 
 
282 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  30.14 
 
 
295 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  30.48 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  30.48 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  30.48 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  29.59 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  29.59 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  29.59 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  29.59 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  29.59 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  29.31 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  29.59 
 
 
292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  30.8 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  30 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  30.94 
 
 
276 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  32.79 
 
 
291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  30.45 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  31.14 
 
 
317 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  31.14 
 
 
317 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  31.44 
 
 
300 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  30.24 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  30.77 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.25 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0824  Taurine dioxygenase  30.9 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  30.45 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>