279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5293 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  100 
 
 
264 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  95.82 
 
 
264 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  71.1 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  41.22 
 
 
278 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  39.78 
 
 
272 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  38.65 
 
 
308 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  37.54 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  37.5 
 
 
314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  37.41 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  37.86 
 
 
317 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  37.86 
 
 
317 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  36.2 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  38.3 
 
 
308 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  36.2 
 
 
316 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.1 
 
 
298 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  38.3 
 
 
308 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  37.05 
 
 
277 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  36.88 
 
 
276 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  38.85 
 
 
322 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  37.14 
 
 
317 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  39.65 
 
 
305 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  38.1 
 
 
273 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  37.14 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  36.79 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  39.36 
 
 
302 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.42 
 
 
305 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  37.94 
 
 
308 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  37.94 
 
 
308 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  38.52 
 
 
287 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  36.79 
 
 
317 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  37.68 
 
 
310 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  38.3 
 
 
302 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  37.59 
 
 
308 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  33.57 
 
 
280 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  39.08 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  37.23 
 
 
298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  36.65 
 
 
315 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  36 
 
 
303 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  36.84 
 
 
299 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  35.11 
 
 
282 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  36.52 
 
 
291 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  35.69 
 
 
298 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  34.27 
 
 
308 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  38.01 
 
 
293 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  36.79 
 
 
315 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  37.22 
 
 
270 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  36.82 
 
 
335 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  36.82 
 
 
277 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  36.17 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  35.59 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  35.59 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  35.88 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  35.31 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  38.06 
 
 
282 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  34.86 
 
 
299 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  36.43 
 
 
315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  35.94 
 
 
315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  36.75 
 
 
304 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  34.15 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  34.55 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  36.65 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  38.72 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  35.51 
 
 
301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  36.46 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  35.11 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  34.15 
 
 
299 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  37.68 
 
 
301 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  35.94 
 
 
318 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  36.49 
 
 
333 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  38.69 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  35.38 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  33.45 
 
 
277 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  35.92 
 
 
295 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  36.82 
 
 
292 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  35.71 
 
 
315 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4934  Taurine dioxygenase  32.86 
 
 
308 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  34.16 
 
 
309 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  35.02 
 
 
277 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  35.71 
 
 
315 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  32.48 
 
 
282 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  32.48 
 
 
282 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  32.48 
 
 
282 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  36.46 
 
 
292 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  36.46 
 
 
292 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  36.46 
 
 
292 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  36.46 
 
 
292 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  36.46 
 
 
292 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  36.46 
 
 
292 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  35.71 
 
 
301 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  36.2 
 
 
282 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  34.06 
 
 
282 aa  158  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  35.51 
 
 
295 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  35.82 
 
 
282 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  32.73 
 
 
277 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  35 
 
 
282 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  34.88 
 
 
281 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  38.69 
 
 
300 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3107  taurine dioxygenase  34.29 
 
 
309 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  34.52 
 
 
281 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.119745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>