273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0930 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0930  putative taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
321 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149442  normal  0.41273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  36.24 
 
 
308 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  34.05 
 
 
277 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  32.97 
 
 
277 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  32.62 
 
 
277 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  32.85 
 
 
280 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  32.62 
 
 
291 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  31.93 
 
 
304 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  29.29 
 
 
314 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  33.33 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  29.17 
 
 
295 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  32.97 
 
 
283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  32.97 
 
 
283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  32.97 
 
 
283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  32.97 
 
 
283 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  32.61 
 
 
283 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  32.48 
 
 
283 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  32.61 
 
 
283 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  32.61 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  32.26 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  33.68 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  32.85 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  32.85 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  32.85 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  33.81 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  30.93 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  30.07 
 
 
335 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  31.72 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08160  Taurine dioxygenase  32.31 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  31.34 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  31.11 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  31.05 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  29.93 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  33.46 
 
 
281 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  30.32 
 
 
272 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  29.93 
 
 
292 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  32.83 
 
 
293 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  31.77 
 
 
316 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  29.86 
 
 
292 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22330  taurine dioxygenase protein  29.86 
 
 
304 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  29.5 
 
 
292 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  29.2 
 
 
292 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  29.2 
 
 
292 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  29.56 
 
 
273 aa  122  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  29.2 
 
 
292 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  29.2 
 
 
292 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  29.2 
 
 
292 aa  122  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4724  taurine dioxygenase  29.68 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  30.37 
 
 
267 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  28.83 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  29.04 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  31.67 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2209  Taurine dioxygenase  29.24 
 
 
310 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  32.62 
 
 
309 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4366  Taurine dioxygenase  31.91 
 
 
309 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  28.37 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  28 
 
 
278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  31.25 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  27.57 
 
 
264 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3041  taurine dioxygenase  30.06 
 
 
333 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122799  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  30.43 
 
 
317 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  29.31 
 
 
289 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  30.43 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  30.6 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  31.23 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  32.47 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  31.23 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  31.23 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  28.18 
 
 
316 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  30.38 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  29.14 
 
 
290 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3967  Taurine dioxygenase  30.88 
 
 
301 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.575031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  30.42 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  28.52 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  30.18 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  28.52 
 
 
316 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  29.82 
 
 
282 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  29 
 
 
303 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  29.29 
 
 
297 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  32.69 
 
 
293 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  28.67 
 
 
308 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  31.85 
 
 
315 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  29.15 
 
 
295 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  27.56 
 
 
280 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  35.48 
 
 
315 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.21 
 
 
305 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  29.72 
 
 
309 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0554  taurine dioxygenase  29.2 
 
 
312 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  29.06 
 
 
289 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  29.33 
 
 
282 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  30.97 
 
 
315 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  28.62 
 
 
282 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  29.21 
 
 
318 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  30.42 
 
 
315 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  26.76 
 
 
305 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  28.77 
 
 
282 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  30.42 
 
 
315 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2918  Taurine dioxygenase  24.81 
 
 
318 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61087  normal  0.0753006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  34.27 
 
 
301 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  27.46 
 
 
280 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>