More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2501 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2501  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
518 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169486  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2784  aldehyde dehydrogenase  65.61 
 
 
581 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2940  aldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
548 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3908  Aldehyde Dehydrogenase  56.38 
 
 
498 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3619  aldehyde dehydrogenase  58.98 
 
 
481 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5460  Aldehyde Dehydrogenase  55.97 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.48 
 
 
499 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1683  putative aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
494 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6115  aldehyde dehydrogenase  59.38 
 
 
501 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4001  aldehyde dehydrogenase  55.88 
 
 
498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  55.34 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4187  Aldehyde Dehydrogenase  57.41 
 
 
496 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3839  Aldehyde Dehydrogenase  57.27 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2558  Aldehyde Dehydrogenase  52.67 
 
 
496 aa  458  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  49.45 
 
 
499 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5231  Aldehyde Dehydrogenase  51.23 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752485  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.04 
 
 
510 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.36 
 
 
522 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  35.57 
 
 
510 aa  277  4e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
505 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
505 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
505 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
512 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 
509 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  36.87 
 
 
531 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20445  predicted protein  33.96 
 
 
524 aa  254  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0181142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  35.03 
 
 
521 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.48 
 
 
483 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.22 
 
 
526 aa  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2095  aldehyde dehydrogenase  39.08 
 
 
516 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  37.47 
 
 
489 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  34.95 
 
 
516 aa  237  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
480 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.43 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  36.01 
 
 
497 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  34 
 
 
533 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.21 
 
 
483 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.73 
 
 
480 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90594  Meiotic Sister-Chromatid recombination aldehyde dehydrogenase  31.24 
 
 
616 aa  231  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.308604 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50750  predicted protein  35.73 
 
 
523 aa  231  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0113332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.26 
 
 
480 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
453 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
469 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
475 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  34.79 
 
 
474 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.66 
 
 
483 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.8 
 
 
540 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
479 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.92 
 
 
480 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.63 
 
 
494 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.92 
 
 
480 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.92 
 
 
480 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.56 
 
 
550 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.7 
 
 
482 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.12 
 
 
479 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  32.63 
 
 
494 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.92 
 
 
480 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  32.63 
 
 
494 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.63 
 
 
494 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
494 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.42 
 
 
494 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
482 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.99 
 
 
482 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
494 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
494 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
490 aa  224  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
482 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
482 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  32.42 
 
 
494 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.42 
 
 
494 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3504  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  33.62 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  33.62 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  36.47 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  36.91 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  35.39 
 
 
501 aa  221  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.73 
 
 
496 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  34.32 
 
 
473 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
482 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.87 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  35.19 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.31 
 
 
538 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  35.41 
 
 
504 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  32.33 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.45 
 
 
489 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
463 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  36.68 
 
 
468 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  33.9 
 
 
502 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
489 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  33.33 
 
 
493 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
480 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>