More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1435 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.36 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.24 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  52.86 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3835  two component LuxR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  50.48 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.93 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.89 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  44.74 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.61 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.96 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  45.33 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4158  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.92 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  43.48 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  43.48 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  43.66 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  41.98 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.13 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.95 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  43.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.32 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  42.72 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  42.41 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  42.33 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  42.72 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 209 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.26 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  41.63 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>