More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1282 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  100 
 
 		 317 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  53.24 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  56.45 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  53.7 
 
 		 413 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  55.65 
 
 		 495 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  56.1 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  54.47 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  53.33 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  54.84 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  51.67 
 
 		 212 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  49.6 
 
 		 254 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.9 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  48.76 
 
 		 180 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  46.67 
 
 		 211 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  47.5 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  41.18 
 
 		 449 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.94 
 
 		 444 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  39.26 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  42.39 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  54.1 
 
 		 232 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  43.57 
 
 		 465 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  46.22 
 
 		 245 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  45.74 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  39.85 
 
 		 203 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  44.63 
 
 		 222 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  41.52 
 
 		 479 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.86 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  44.54 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  44.44 
 
 		 347 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  51.61 
 
 		 334 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  47.9 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  44.36 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  44.07 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  44.36 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  44.36 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  44.36 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  44.36 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  44.36 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  44.36 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  44.36 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  43.61 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  44.62 
 
 		 167 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  47.93 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  43.61 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  44.53 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  41.04 
 
 		 458 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  39.58 
 
 		 200 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  41.1 
 
 		 545 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  45.38 
 
 		 255 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  39.88 
 
 		 493 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  46.22 
 
 		 244 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  45.11 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  46.22 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  33.53 
 
 		 179 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  37.65 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  41.18 
 
 		 206 aa  92.4  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  37.12 
 
 		 242 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.83 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  40.91 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  42.99 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  48.04 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  43.7 
 
 		 500 aa  90.5  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  41.67 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  46.73 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  45.28 
 
 		 200 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  41.67 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  39.02 
 
 		 541 aa  89.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  44.9 
 
 		 222 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  41.86 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  41.8 
 
 		 450 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  44.55 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  47.52 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  44.12 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  45.45 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  39.2 
 
 		 270 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  39.85 
 
 		 178 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  35.9 
 
 		 192 aa  85.9  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  47.06 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2441  SCP-like extracellular  41.8 
 
 		 194 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  43.1 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  43.93 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  36.84 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  44.83 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  44.12 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  34.56 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.81 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  41.28 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1864  SCP-like extracellular  36.64 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  38.64 
 
 		 528 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  32.81 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  40.34 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  37.86 
 
 		 169 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  35.46 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  42.57 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  33.1 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  38.71 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1857  SCP-like extracellular  34.44 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.539147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.71 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  38.34 
 
 		 722 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  39.16 
 
 		 689 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.276836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>