112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4030 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4030  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  82.1 
 
 		 302 aa  271  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3639  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  167  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563989  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  54.04 
 
 		 279 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  55.21 
 
 		 280 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0574  hypothetical protein  51.46 
 
 		 214 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  55.83 
 
 		 288 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  54.88 
 
 		 290 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  51.85 
 
 		 215 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  52.44 
 
 		 279 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  47.85 
 
 		 306 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  49.38 
 
 		 273 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  42.59 
 
 		 277 aa  127  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  44.51 
 
 		 268 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  41.98 
 
 		 279 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  51.56 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1745  hypothetical protein  43.6 
 
 		 218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0889269  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  46.01 
 
 		 270 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  42.42 
 
 		 293 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  43.21 
 
 		 271 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  40.99 
 
 		 268 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  40.85 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0403  hypothetical protein  43.88 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  39.88 
 
 		 268 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  39.13 
 
 		 288 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  38.55 
 
 		 275 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  39.63 
 
 		 266 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  38.65 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  39.51 
 
 		 262 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  39.51 
 
 		 268 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  37.89 
 
 		 268 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  60.22 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  36.65 
 
 		 279 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  37.42 
 
 		 333 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  37.27 
 
 		 272 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  39.88 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  37.8 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  39.75 
 
 		 283 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  38.36 
 
 		 271 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  38.89 
 
 		 271 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  37.2 
 
 		 265 aa  98.2  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  35.8 
 
 		 270 aa  97.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  36.65 
 
 		 267 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  34.16 
 
 		 269 aa  97.1  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  35.15 
 
 		 266 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  35.98 
 
 		 280 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  41.32 
 
 		 271 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  37.65 
 
 		 268 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  37.95 
 
 		 271 aa  95.5  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  39.52 
 
 		 263 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  36.05 
 
 		 276 aa  94.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  38.27 
 
 		 267 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  36.63 
 
 		 270 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1516  hypothetical protein  42.57 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  37.42 
 
 		 281 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  37.13 
 
 		 277 aa  90.9  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  35.4 
 
 		 277 aa  90.9  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  36.81 
 
 		 268 aa  90.9  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  36.2 
 
 		 272 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3109  hypothetical protein  44.35 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  34.38 
 
 		 265 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  32.1 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  36.31 
 
 		 262 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  34.94 
 
 		 267 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  36.59 
 
 		 274 aa  84.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  36.81 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  32.17 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  32.24 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  36.11 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  33.13 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  34.9 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  31.76 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  35.98 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  38.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  35.1 
 
 		 271 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3081  hypothetical protein  56.06 
 
 		 72 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  32.92 
 
 		 283 aa  77.4  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4667  protein of unknown function DUF574  36.25 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  34.73 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  34.48 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  31.55 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  33.1 
 
 		 273 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  37.06 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3527  hypothetical protein  49.37 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672122  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  30.72 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  29.81 
 
 		 323 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  31.71 
 
 		 269 aa  71.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  36.43 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  29.83 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  29.63 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  33.81 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1307  protein of unknown function DUF574  28.92 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0163333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08330  Protein of unknown function (DUF574)  31.72 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  29.94 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  31.15 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  30.59 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0528  protein of unknown function DUF574  29.01 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253629  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  30.59 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>