More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3743 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  100 
 
 		 331 aa  660    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  85.25 
 
 		 245 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  62.71 
 
 		 245 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  63.98 
 
 		 255 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  61.11 
 
 		 249 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  57.2 
 
 		 252 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  57.2 
 
 		 246 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  51.69 
 
 		 252 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  54.17 
 
 		 246 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  53.91 
 
 		 255 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  50.64 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  51.87 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  51.87 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  51.04 
 
 		 252 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  48.76 
 
 		 254 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  48.97 
 
 		 255 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.85 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.32 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.88 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  31.78 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.16 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  35 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  33.66 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.47 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.84 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 197 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 266 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.83 
 
 		 233 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 223 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 581 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  41.54 
 
 		 237 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 		 232 aa  52.8  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.84 
 
 		 234 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 233 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.21 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 457 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.19 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  50 
 
 		 202 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.4 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.25 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  47.37 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 222 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  33.01 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.44 
 
 		 249 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.81 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2580  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.04 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 272 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3277  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 190 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.66 
 
 		 258 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.78 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  32.64 
 
 		 269 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.27 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  40.66 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 234 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>