238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2934 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 402 aa  815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  57.58 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  56.09 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  40.75 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  40 
 
 		 442 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  39.02 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  39.42 
 
 		 444 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  41.86 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  41.06 
 
 		 397 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 407 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  36.49 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  31.09 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  31.71 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  29.09 
 
 		 507 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  28.02 
 
 		 411 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.2 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  27.81 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  27.81 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.82 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  26.62 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  26.57 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  26.61 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  26.57 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  26.57 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  26.36 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  26.57 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  28.92 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  26.06 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  25.67 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 455 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  25.57 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  25.67 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  25.57 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  26.14 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  24.28 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  26.06 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.09 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  23.05 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.15 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.27 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  26.39 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  28.03 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  26.81 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1576  putative monooxygenase  26.06 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472277  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  23.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.63 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  25.3 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  24.81 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  26.13 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.4 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  24.25 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  36.89 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  24.57 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  24.57 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  32.14 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2421  putative monooxygenase  25.46 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  24.92 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1219  putative monooxygenase  25.46 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00380078  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1144  putative monooxygenase  25.46 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.670847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  26.9 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0696  putative monooxygenase  25.46 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0540721  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  22.87 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0770  putative monooxygenase  25.46 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.522816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1734  putative monooxygenase  25.46 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  27.84 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.58 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  26.42 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0904  putative monooxygenase  29.13 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88065  predicted protein  24.77 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0632096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.79 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  28.03 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  26.35 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  25.83 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.65 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  24.48 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5964  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.76 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  38.36 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68955  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.12 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  25.93 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09700  putative monooxygenase  27.87 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>