44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0914 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  72.9 
 
 		 228 aa  204  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  42.58 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  45.27 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  42.86 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  40.24 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  47.22 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  44.22 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  41.5 
 
 		 228 aa  92.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  38.81 
 
 		 138 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5708  DoxX family protein  39.47 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  50 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  37.31 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  38.13 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  37.84 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  38.13 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  37.31 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  31.5 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  34.4 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  38.75 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  35.37 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  38.26 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  35.38 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  35.61 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  39.58 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  32.74 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  36.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  31.18 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  37.59 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  36.57 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  31.82 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  27.78 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  34.41 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  33.96 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  28.15 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0405  hypothetical protein  27.87 
 
 		 360 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  30.84 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  25.45 
 
 		 364 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  25 
 
 		 297 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  25 
 
 		 373 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3661  DoxX family protein  29.09 
 
 		 383 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  38.61 
 
 		 154 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>