99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4213 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
453 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  59.07 
 
 
467 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  54.17 
 
 
460 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  51.61 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  45.56 
 
 
447 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  27.58 
 
 
456 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  27.02 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  28.12 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  28.15 
 
 
459 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  28.38 
 
 
459 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  26.18 
 
 
468 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  29.41 
 
 
463 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  25 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  27.67 
 
 
515 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  24.92 
 
 
483 aa  113  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  22.88 
 
 
493 aa  93.2  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  25.28 
 
 
482 aa  90.5  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  22.98 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  23.81 
 
 
505 aa  66.6  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  22.47 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  22.47 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  22.47 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  22.76 
 
 
482 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  23.13 
 
 
482 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  22.96 
 
 
472 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  22.76 
 
 
482 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  22.56 
 
 
520 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  22.47 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  22.93 
 
 
485 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.145473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  22.47 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  24.64 
 
 
500 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  22.96 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  22.22 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  22.59 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  22.22 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  21.5 
 
 
509 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  24.73 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  24.32 
 
 
489 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  23.01 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  23.66 
 
 
472 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  23.74 
 
 
489 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  24.58 
 
 
474 aa  57  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  26.13 
 
 
485 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4671  carbohydrate kinase FGGY  22.46 
 
 
464 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165278  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  23.74 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  23.74 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  22.96 
 
 
489 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0722  carbohydrate kinase, FGGY  22.02 
 
 
491 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285117  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  23.35 
 
 
489 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.19 
 
 
497 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  20.39 
 
 
479 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  21.05 
 
 
524 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  22.92 
 
 
518 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  23.88 
 
 
496 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  25 
 
 
502 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  25.43 
 
 
494 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  25.43 
 
 
494 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.61 
 
 
500 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  20.42 
 
 
514 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  25 
 
 
502 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  22.22 
 
 
502 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  21.07 
 
 
515 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  25.95 
 
 
509 aa  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  24.86 
 
 
494 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  22.16 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2493  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  24.22 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  24.28 
 
 
494 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  22.75 
 
 
513 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  23.27 
 
 
513 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  21.57 
 
 
513 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  22.97 
 
 
492 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  22.97 
 
 
492 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0409  glycerol kinase  23.13 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  22.22 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  22.22 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  22.22 
 
 
513 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  24.12 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  23 
 
 
515 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  21.32 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  21.21 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  21.32 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  21.25 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  21.89 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  21.32 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  22.37 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  19.05 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  25.7 
 
 
505 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  21.13 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  22.22 
 
 
513 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  21.64 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  23.3 
 
 
493 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  23.83 
 
 
509 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  19.79 
 
 
530 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  21.28 
 
 
501 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  22.34 
 
 
489 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  22.15 
 
 
498 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  20.54 
 
 
489 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  22.15 
 
 
498 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  22.15 
 
 
498 aa  43.1  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>