More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2089 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
310 aa  620  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  71.99 
 
 
326 aa  424  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  71.63 
 
 
327 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  68.06 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  68.2 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  58.23 
 
 
311 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  65.72 
 
 
308 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  62.63 
 
 
311 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  61.21 
 
 
305 aa  360  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  59.03 
 
 
301 aa  358  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  60.14 
 
 
309 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  59.43 
 
 
309 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  54.2 
 
 
295 aa  318  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  57.61 
 
 
326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  60.48 
 
 
326 aa  299  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  52.96 
 
 
312 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  52.96 
 
 
328 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  52.96 
 
 
328 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  52.96 
 
 
328 aa  291  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.96 
 
 
328 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.96 
 
 
328 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.96 
 
 
328 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.96 
 
 
328 aa  291  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  53.49 
 
 
317 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  52.22 
 
 
311 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  52.71 
 
 
317 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  53.1 
 
 
347 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  52.71 
 
 
317 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  53.76 
 
 
314 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  51.67 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.78 
 
 
313 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  52.71 
 
 
317 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51.55 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  52.33 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  54.84 
 
 
314 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  50.78 
 
 
313 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  50.78 
 
 
313 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
309 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
313 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  50.78 
 
 
311 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  49.09 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.44 
 
 
311 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.44 
 
 
311 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  52.44 
 
 
311 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.44 
 
 
311 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  52.44 
 
 
397 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  52.44 
 
 
311 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  52.44 
 
 
406 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.41 
 
 
313 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51.17 
 
 
311 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  50.78 
 
 
310 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  50.39 
 
 
310 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  50.39 
 
 
310 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  51.21 
 
 
312 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  48.76 
 
 
335 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 
313 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  50.4 
 
 
313 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.13 
 
 
314 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  49.62 
 
 
332 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  49.06 
 
 
341 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  44.93 
 
 
354 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  41.16 
 
 
348 aa  202  7e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  41.94 
 
 
339 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  43.3 
 
 
331 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  42.75 
 
 
734 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  42.35 
 
 
337 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  31.85 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.33 
 
 
313 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
304 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  31.45 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  28.32 
 
 
323 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  28.96 
 
 
312 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  30.12 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  27.48 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  28.57 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  36.3 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.46 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.47 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  27.12 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.53 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  27.65 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.53 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.53 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5457  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00912634  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  29.83 
 
 
583 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2296  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0087  extracellular solute-binding protein family 3  27.13 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.26 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.26 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.63 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.06 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.26 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.26 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>