More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2296 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2296  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2235  extracellular solute-binding protein  77.22 
 
 
279 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0981376  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2305  extracellular solute-binding protein family 3  61.54 
 
 
279 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000714042  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0214  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  52 
 
 
516 aa  281  9e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.002492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0751  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  54.96 
 
 
545 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0389728  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.94 
 
 
510 aa  256  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1532  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.33 
 
 
521 aa  248  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000742364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0136  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  48.54 
 
 
516 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000337877  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0086  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  48.83 
 
 
537 aa  245  6.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0796672  normal  0.210719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  31.32 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  30.04 
 
 
278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.68 
 
 
278 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  31.37 
 
 
485 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.21 
 
 
485 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.21 
 
 
485 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 
268 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 
260 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.68 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  31.27 
 
 
256 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
250 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.25 
 
 
259 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.51 
 
 
259 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.51 
 
 
259 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.51 
 
 
259 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
259 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.89 
 
 
259 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  28.08 
 
 
309 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.89 
 
 
259 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  31.72 
 
 
271 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.14 
 
 
259 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
310 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 
246 aa  100  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.59 
 
 
276 aa  99  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.21 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
261 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.35 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.6 
 
 
503 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  31.58 
 
 
490 aa  95.5  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.77 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
248 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.82 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
242 aa  92.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  31.14 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  31.14 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  31.01 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  29.82 
 
 
251 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  29.88 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  29.82 
 
 
501 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
245 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  31.47 
 
 
273 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.36 
 
 
282 aa  89  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  32.02 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  29.18 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  32.02 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.77 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.77 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.22 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
254 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  35 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
244 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  28.47 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.62 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.24 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.73 
 
 
257 aa  85.9  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
244 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.27 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  26.61 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.73 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  27.51 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  29.55 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  28.82 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>