34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4820 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  53.98 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  52.25 
 
 		 367 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  49.11 
 
 		 311 aa  134  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  50 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  43.84 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  40 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  46.9 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  33.69 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  45.05 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  43.52 
 
 		 314 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  42.59 
 
 		 267 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 297 aa  99  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  39.25 
 
 		 266 aa  95.5  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  37.98 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  42.31 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  38.02 
 
 		 268 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  58.33 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  39.09 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  39.09 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  40.78 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4907  hypothetical protein  90.32 
 
 		 40 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  39.19 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  27.16 
 
 		 431 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5551  restriction endonuclease-like protein  30.77 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  38.6 
 
 		 283 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  29.35 
 
 		 426 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  36.62 
 
 		 376 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  29.07 
 
 		 282 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3530  hypothetical protein  28.16 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.981838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>