52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3418 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  100 
 
 		 178 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  98.88 
 
 		 178 aa  361  3e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  98.88 
 
 		 178 aa  361  4e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  94.38 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  93.82 
 
 		 178 aa  346  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  93.82 
 
 		 178 aa  346  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  91.57 
 
 		 178 aa  340  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  31.54 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  32 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  30.87 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  29.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  29.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  29.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  29.61 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  23.49 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  28.28 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  30 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  26.9 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  28.37 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  28.95 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  28 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  26.75 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  27.1 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  29.13 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  28 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  27.33 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  25.64 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  26.17 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  29.41 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  27.7 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  30.19 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  28.57 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  28.21 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  26.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  27.97 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  26.17 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  25.33 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  24.67 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  24.67 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  29.37 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  29.37 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  27.15 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  25.33 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  32.41 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  25.31 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  26.28 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2917  general secretion pathway M protein  28.68 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  26.17 
 
 		 162 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  25.47 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  24.18 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>