More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1649 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1649  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.110887  normal  0.355464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1694  response regulator receiver domain-containing protein  79.56 
 
 		 137 aa  229  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0226  response regulator receiver protein  85.29 
 
 		 137 aa  224  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.120465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0539  response regulator receiver protein  48.46 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2860  response regulator receiver protein  48.46 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1286  chemotaxis protein CheY  51.54 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2431  response regulator receiver domain-containing protein  51.54 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000210514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0774  response regulator receiver domain-containing protein  48.46 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1427  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1742  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000010553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3528  response regulator receiver protein  47.66 
 
 		 130 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0805  response regulator receiver protein  40.77 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00141672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0617  response regulator receiver protein  44.62 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1327  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0355  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000313878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0375  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0863  response regulator receiver protein  35.56 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2249  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1975  response regulator receiver protein  36.92 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0684  chemotaxis protein CheY  39.66 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4540  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0265  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0876  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  38.4 
 
 		 1347 aa  73.6  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1788 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3848  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.84 
 
 		 703 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1691 aa  70.1  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  37.3 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  36.15 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 649 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1027 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.71 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2590  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  38.76 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  30.95 
 
 		 891 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  34.65 
 
 		 544 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0902  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.66 
 
 		 718 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.651526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.9 
 
 		 860 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  36.43 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.9 
 
 		 860 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2837  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000598352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.07 
 
 		 311 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  37.98 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.07 
 
 		 311 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.98 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 227 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 754 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  33.33 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04818  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06140)  37.12 
 
 		 1243 aa  62.8  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.25404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 927 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 807 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 970 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4108  diguanylate cyclase  37.1 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.87577  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 441 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 227 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  34.88 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  32.81 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  39.5 
 
 		 734 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  29.13 
 
 		 676 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  32.81 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  37.98 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 577 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1018  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 441 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00729938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 		 364 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 924 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  35.66 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  32.81 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  33.07 
 
 		 568 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  32.81 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  31.93 
 
 		 650 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 		 243 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  32.81 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  32.81 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  32.81 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 874 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  32.81 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  37.72 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  32.81 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  32.37 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2642  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>