63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0104 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  775    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  78.76 
 
 		 375 aa  628  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  63.54 
 
 		 376 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  64.34 
 
 		 376 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  62.1 
 
 		 376 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  62.57 
 
 		 376 aa  495  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  60.59 
 
 		 376 aa  478  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  39.03 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  39.03 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  37.89 
 
 		 368 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  29.84 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  26.57 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  28.71 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  26.29 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  31.25 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.62 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  28.78 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  23.95 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.08 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.18 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.85 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  25.08 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  25.81 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  23.78 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  24.17 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.5 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  23.69 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  21.61 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.42 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  24.88 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  28.78 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.78 
 
 		 659 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  30.16 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  28.14 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  27.18 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  27.18 
 
 		 372 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 		 609 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 		 609 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.41 
 
 		 609 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  26.42 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.62 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  25.71 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4564  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33 
 
 		 610 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0011  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.3 
 
 		 609 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.855162  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  27.56 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1366  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.37 
 
 		 607 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  29.92 
 
 		 609 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4142  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.5  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4070  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 609 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2618  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 		 608 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4261  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.67 
 
 		 610 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>