More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1522 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  100 
 
 
358 aa  739    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  84.92 
 
 
358 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  68.45 
 
 
360 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  65.55 
 
 
359 aa  511  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  63.23 
 
 
359 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  59.27 
 
 
359 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  58.71 
 
 
359 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  59.22 
 
 
358 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  57.66 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  59.22 
 
 
358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  57.87 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  58.15 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  56.55 
 
 
359 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  57.1 
 
 
359 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  54.78 
 
 
358 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  55.99 
 
 
359 aa  431  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.48 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  55.03 
 
 
362 aa  411  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  55.03 
 
 
358 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  52.81 
 
 
359 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  53.35 
 
 
362 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  53.63 
 
 
362 aa  393  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.44 
 
 
409 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.61 
 
 
409 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  42.35 
 
 
419 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  43.21 
 
 
361 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.06 
 
 
537 aa  300  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.45 
 
 
361 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.68 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  42.74 
 
 
561 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  39.83 
 
 
377 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  37.85 
 
 
360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  39.73 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  36.86 
 
 
406 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.89 
 
 
567 aa  263  3e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.48 
 
 
574 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.13 
 
 
409 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.72 
 
 
557 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.72 
 
 
557 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
362 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  37.82 
 
 
571 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  37.82 
 
 
571 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  37.82 
 
 
571 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.97 
 
 
579 aa  245  9e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.88 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  37.25 
 
 
571 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  37.19 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.47 
 
 
571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.31 
 
 
567 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.29 
 
 
575 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.24 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.73 
 
 
575 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.73 
 
 
359 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 
375 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  34.17 
 
 
378 aa  232  9e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 
375 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.38 
 
 
376 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  35.47 
 
 
576 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  35.47 
 
 
576 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  35.47 
 
 
569 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.47 
 
 
569 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  35.47 
 
 
569 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  35.47 
 
 
569 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.47 
 
 
569 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  35.47 
 
 
569 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  35.2 
 
 
569 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  35.47 
 
 
569 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  35.47 
 
 
569 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  35.47 
 
 
569 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  35.47 
 
 
569 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  35.47 
 
 
569 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  36.46 
 
 
576 aa  227  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.6 
 
 
374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.18 
 
 
569 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  35.67 
 
 
555 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.67 
 
 
555 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  35.67 
 
 
555 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.67 
 
 
555 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  34.07 
 
 
582 aa  224  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.26 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.17 
 
 
578 aa  220  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  35.39 
 
 
555 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0401  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.53 
 
 
375 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  33.61 
 
 
578 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1518  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.25 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100115  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.44 
 
 
375 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.706219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.36 
 
 
381 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  37.25 
 
 
367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0473  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.330146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.71 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.64 
 
 
401 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0306  NADH dehydrogenase (quinone)  32.59 
 
 
374 aa  210  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  35.36 
 
 
367 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0572  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.36 
 
 
361 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.591606  decreased coverage  0.000177209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.96 
 
 
525 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.38 
 
 
441 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  35.08 
 
 
367 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.1 
 
 
358 aa  206  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>