218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0668 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  100 
 
 		 393 aa  802    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  75 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  49.87 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  40.11 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  34.72 
 
 		 439 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  30.77 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  26.62 
 
 		 467 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  27.74 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  26.6 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  26.18 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  23.8 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  21.76 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  26.22 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  29.57 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  25.97 
 
 		 695 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  32.77 
 
 		 525 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  25.08 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  23.72 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  27.8 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  29.02 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  22.26 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  22.34 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  22.34 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  22.34 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  26.32 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  24.37 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  24.71 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  24.68 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  26.69 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  23.85 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  27.97 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  23.12 
 
 		 1165 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  25.39 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  23.53 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1360  pyruvate carboxylase  25.14 
 
 		 1147 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0615601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  25.71 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3839  pyruvate carboxylase  23.68 
 
 		 1154 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.04 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  24.41 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  24.41 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  22.53 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  22.26 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7328  pyruvate carboxylase  24.84 
 
 		 1172 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2317  pyruvate carboxylase  26.43 
 
 		 1146 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.65 
 
 		 1065 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  24.12 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  22.37 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2669  pyruvate carboxylase  24.4 
 
 		 1164 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0529984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  24.37 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  22.5 
 
 		 1154 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.62 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4597  pyruvate carboxylase  23.51 
 
 		 1157 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2352  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.51 
 
 		 1074 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.374511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1119  pyruvate carboxylase  24.22 
 
 		 1169 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.88 
 
 		 1082 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  24.76 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4016  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.69 
 
 		 1065 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.81 
 
 		 1066 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.78 
 
 		 1079 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  24.37 
 
 		 1184 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.88 
 
 		 1040 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  23.75 
 
 		 1158 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.05 
 
 		 1042 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  22.5 
 
 		 1153 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  23.75 
 
 		 1158 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  27.38 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23 
 
 		 1060 aa  57.4  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  26.28 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1121  pyruvate carboxylase  26.48 
 
 		 1153 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  23.91 
 
 		 1169 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1057  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.83 
 
 		 1103 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.614826  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5521  pyruvate carboxylase  23.71 
 
 		 1173 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  28.46 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.65 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.11 
 
 		 1071 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3713  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.72 
 
 		 1072 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.65 
 
 		 1057 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.65 
 
 		 1065 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  23.78 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  26.09 
 
 		 484 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0615  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23 
 
 		 1064 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.120313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  25.83 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.36 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1120  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  24.17 
 
 		 554 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.33 
 
 		 1067 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.45 
 
 		 1066 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.123492 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1057 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1057 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  27.64 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1257  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.38 
 
 		 1072 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02890  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.95 
 
 		 1067 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.5 
 
 		 1075 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  23.35 
 
 		 1147 aa  54.3  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.81 
 
 		 1106 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0559  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.97 
 
 		 1059 aa  53.9  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3628  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.72 
 
 		 1072 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2090  pyruvate carboxylase  24.47 
 
 		 1154 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0765  pyruvate carboxylase  24.47 
 
 		 1154 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>