More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0615 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
388 aa  751    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  57.07 
 
 
341 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  56.3 
 
 
351 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2512  glycosyl transferase family 9  44.08 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.122114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  42.32 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.79 
 
 
516 aa  116  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  38.98 
 
 
344 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  29.71 
 
 
357 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.48 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  46.28 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  24.87 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1515  glycosyl transferase family 9  22.52 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  34.9 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
344 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  26.29 
 
 
779 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.49 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.27 
 
 
348 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.81 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.81 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  29.06 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.75 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.81 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  27.47 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  28.81 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  37.36 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.93 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.93 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.79 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  21.73 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  28.81 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  34.68 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.13 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.57 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.85 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0353  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0668  glycosyl transferase family 9  24.06 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000239845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  27.75 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  26.93 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.56 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  28.54 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  35.06 
 
 
343 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2822  glycosyl transferase family 9  26.75 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.44 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  22.7 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  23.48 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  25.6 
 
 
334 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.91 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0457  glycosyl transferase family 9  30.92 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.63 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  38.83 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.32 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  28.64 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  28.27 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.8 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
406 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  25.54 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  32.84 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  27.68 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  42.24 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1046  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1722  glycosyl transferase family 9  25.51 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  26.65 
 
 
574 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.02 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  25.07 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  23.32 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.41 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.78 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  39.82 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.58 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.87 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.57 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  25.91 
 
 
355 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.2 
 
 
349 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.78 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.44 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  30.6 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.87 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.96 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  21.37 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.61 
 
 
325 aa  65.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.77 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.86 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0580  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.32 
 
 
316 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.604166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.06 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2459  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase, glycosyl transferase, family 9  29.86 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262404  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.84 
 
 
343 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.19 
 
 
353 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.84 
 
 
343 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  48.15 
 
 
332 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  31.89 
 
 
349 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>