68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0388 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  47.14 
 
 		 239 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  38.5 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  38.97 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  26.12 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  25.97 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  25.97 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  24.6 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  25.81 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  25.2 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  26.18 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  24.8 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  30.39 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  25.48 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  27.66 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0053  hypothetical protein  25.64 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3185  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3191  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1182  extracellular solute-binding protein family 3  25.43 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  25.9 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1142  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000284369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.09 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  34.52 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  26.79 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  28.88 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3329  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  28.89 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  26.96 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  22.18 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  32.43 
 
 		 575 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2779  amino acid ABC transporter  25.45 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  32.43 
 
 		 578 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3932  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.91 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1260  amino acid ABC transporter  25.11 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  27.2 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  29.69 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  31.53 
 
 		 578 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 457 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  27.62 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  30.17 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1179  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 		 385 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0067  hypothetical protein  30.4 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.836373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  29.31 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1294  hypothetical protein  21.03 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.17 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  31.54 
 
 		 597 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1085  hypothetical protein  24.89 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3844  hypothetical protein  25.52 
 
 		 225 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.718415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2175  histidine kinase  30.77 
 
 		 599 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 256 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  23.31 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  26.11 
 
 		 502 aa  42  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  26.11 
 
 		 502 aa  42  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  23.67 
 
 		 268 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>