34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0809 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  55.76 
 
 		 274 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  50.67 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  26.92 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  26.29 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  26.29 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  24.59 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  27.5 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  27.5 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  23.04 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  27 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  24.08 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  24.62 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 631 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  26.29 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  19.2 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.71 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.71 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1294  hypothetical protein  23.73 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.03 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.63 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  24.44 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  25.13 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1151  hypothetical protein  22.96 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000453875  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  23.36 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1085  hypothetical protein  22.96 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0391886  normal  0.830979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  23.36 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>