23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0426 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  36.07 
 
 
239 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  39.34 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  24.58 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  24.58 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  29.19 
 
 
247 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  23.65 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  24.63 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  31.06 
 
 
578 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  21.52 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  23.32 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  23.32 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  23.32 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  29.55 
 
 
575 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1854  histidine kinase  29.55 
 
 
578 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0945  ribosomal protein L15  32.98 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000657497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  23.83 
 
 
246 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  24.44 
 
 
237 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  23.65 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1240  extracellular solute-binding protein  34.94 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.64 
 
 
243 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>