18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0736 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  62.65 
 
 		 271 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  62.89 
 
 		 266 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  62.65 
 
 		 271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  52.8 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  51.17 
 
 		 275 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  50.78 
 
 		 275 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  31.44 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  30.08 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  26.8 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  26.25 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  24.29 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  26.15 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  26.29 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  27.18 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  24.63 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  25.87 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3081  hypothetical protein  25.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0257999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>