23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2231 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  55.76 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  50.44 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  27.51 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  27.08 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  24.34 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  25.4 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  27.05 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  27.05 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  21.97 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  22.6 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  22.6 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  25.87 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1294  hypothetical protein  24.19 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 631 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  21.36 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  28.32 
 
 		 935 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  21.5 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  20.87 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  23.78 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  22.96 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.81 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>