21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2636 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  50.67 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  50.44 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  26.36 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  23.83 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  23.81 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  23.81 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  36.49 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  36.49 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  35.21 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  23.83 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  25.44 
 
 		 598 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  23.21 
 
 		 596 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 604 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 631 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  23.04 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  22.43 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  20.67 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  27.19 
 
 		 250 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1294  hypothetical protein  24.34 
 
 		 243 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>