23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0684 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  99.63 
 
 
271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  97.36 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  62.65 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  57.81 
 
 
266 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  58.91 
 
 
275 aa  308  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  58.91 
 
 
275 aa  308  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  31.58 
 
 
248 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  30.21 
 
 
250 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  27.6 
 
 
246 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  31.61 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  28.22 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  26.18 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  25.4 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  27.5 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  36.49 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  23.32 
 
 
299 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3081  hypothetical protein  26.02 
 
 
231 aa  49.7  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0257999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0053  hypothetical protein  20.82 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
270 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
252 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>