More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1431 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1431  transport system permease protein  100 
 
 		 312 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.11 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  39.72 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.98 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.08 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  40.71 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.5 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.41 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.77 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  37.2 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.77 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.28 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.36 
 
 		 363 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  37.37 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.36 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  38.33 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.72 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.72 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  39.1 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  35 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.57 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  33.68 
 
 		 367 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  33.79 
 
 		 355 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  39.8 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.35 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.08 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  35.37 
 
 		 344 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  39.38 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  35.23 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  34.41 
 
 		 370 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  36.24 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.92 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.9 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  34.82 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  36.68 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  32.43 
 
 		 351 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.81 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  35 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.69 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  35 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  35 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  35 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  35.69 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  35.69 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  35.69 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  34.64 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  33.68 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  35.21 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  35.21 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  34.69 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  34.83 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.17 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  35.71 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  33.93 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.14 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  34.92 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.07 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  38.57 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  31.93 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  35.09 
 
 		 354 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  36.81 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  35.96 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  33.69 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.51 
 
 		 367 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.11 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  34.27 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  32.39 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.12 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  33.33 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  35.27 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  34.49 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  38.21 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  32.87 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  32.97 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  35.13 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  35.67 
 
 		 357 aa  165  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.37 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  32.56 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  38.01 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.86 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  35.66 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  33.92 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  33.91 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  36.84 
 
 		 345 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  37.82 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  37.76 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  33.93 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.25 
 
 		 345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.4 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  32.04 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  33.1 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  33.22 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  36.43 
 
 		 354 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3048  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  36.84 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>