More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1615 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  96.04 
 
 		 202 aa  348  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  67.71 
 
 		 203 aa  261  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  71.35 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  66.15 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  59.8 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  60.11 
 
 		 191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  60.66 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  61.17 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  57.14 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  57.37 
 
 		 196 aa  191  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  57.95 
 
 		 233 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  42.71 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  39.06 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  43.75 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  37.36 
 
 		 178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  42.56 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  41.04 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  45.4 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  37.63 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  39.77 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  41.53 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  41.86 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  40.78 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  40.48 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  39.88 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  39.13 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  41.77 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  40.46 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  40.46 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  35.83 
 
 		 189 aa  94.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  36.41 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  40.46 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  40.57 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  40.57 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  39.53 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  41.11 
 
 		 361 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  37.97 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  39.89 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  35.76 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  41.46 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  40.62 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  40.72 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  42.16 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  41.51 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  41.51 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  37.35 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  34.46 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  34.46 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  34.36 
 
 		 454 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.61 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  42.37 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  34.1 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  34.29 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  36.51 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.59 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  33.53 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  33.53 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.29 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  39.26 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  31.79 
 
 		 456 aa  75.5  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.54 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  29.82 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  33.73 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  26.52 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  30.29 
 
 		 454 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  31.82 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.82 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  32.2 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  30.92 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.04 
 
 		 428 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  32.65 
 
 		 445 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  29.82 
 
 		 456 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  31.13 
 
 		 401 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.61 
 
 		 396 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  30.28 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  31.61 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  33.82 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  31.61 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  31.61 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  31.61 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  31.98 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  25.76 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  29.87 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.31 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.78 
 
 		 415 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  31.06 
 
 		 390 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.54 
 
 		 416 aa  68.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  31.06 
 
 		 390 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  31.06 
 
 		 390 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.11 
 
 		 465 aa  67.8  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.83 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  29.7 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.59 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  27.62 
 
 		 452 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  31.97 
 
 		 483 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  32.96 
 
 		 431 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  34.11 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  32.68 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  29.05 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>