More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1828 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  100 
 
 		 341 aa  711    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  64.44 
 
 		 459 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  64.13 
 
 		 459 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  64.13 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  64.13 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  57.88 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  57.88 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  57.88 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  57.88 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  72.95 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  42.96 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  42.96 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  42.96 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  43.21 
 
 		 416 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  36.77 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2501  integrase catalytic subunit  38.06 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1688  integrase catalytic subunit  38.06 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0571  integrase catalytic subunit  38.06 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2928  integrase catalytic subunit  38.06 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171579  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5446  integrase catalytic subunit  39.26 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5572  integrase catalytic subunit  37.45 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4946  Integrase catalytic region  34.58 
 
 		 489 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  33.54 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1285  Integrase catalytic region  32.64 
 
 		 493 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.543739  normal  0.626135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4520  Integrase catalytic region  32.64 
 
 		 493 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3744  Integrase catalytic region  32.64 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190412  normal  0.14129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3237  hypothetical protein  49.12 
 
 		 119 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6374  transposase Tn6049  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.038009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6335  transposase Tn6049  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000710666  hitchhiker  0.00105142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0321  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2000  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0911973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2008  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160475  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2405  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000242595  decreased coverage  0.0000044189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2552  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.338431  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2837  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3142  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.943926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3931  transposase Tn6049  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0145396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4424  transposase Tn6049  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0079465  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5480  transposase Tn6049  30.77 
 
 		 479 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2853  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 		 462 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0458  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 		 484 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0942  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 		 484 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1322  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 		 484 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1330  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 		 484 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2125  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 		 484 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2273  integrase catalytic subunit  28.83 
 
 		 484 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6466  Integrase catalytic region  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0099  Integrase catalytic region  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0130  Integrase catalytic region  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5181  Integrase catalytic region  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6582  Integrase catalytic region  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0318996 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7260  Integrase catalytic region  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1122  putative transposase protein  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0710  putative integrase  24.02 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.112967 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0220  putative transposase  29.38 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0145675 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0072  transposase  29.38 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  26.55 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5462  transposase  26.49 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2822  integrase catalytic region  31.82 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2745  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  25.12 
 
 		 597 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3875  integrase catalytic region  24.9 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.936093 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4082  integrase catalytic region  24.9 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0484563 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3679  integrase catalytic region  24.9 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.703248  normal  0.776463 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4385  integrase catalytic subunit  23.08 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2180  integrase catalytic region  26.29 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0943007  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  24.34 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3826  integrase catalytic subunit  28.41 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0795  Integrase catalytic region  26.1 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3129  Transposase-like Mu  24.91 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.509009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4336  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0872722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0598  Integrase catalytic region  27.27 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.53363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4748  Integrase catalytic region  26.2 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2199  Transposase-like Mu  24.91 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5252  integrase catalytic region  27.07 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5024  integrase catalytic region  27.07 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2281  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00884942  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2282  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0155582  normal  0.016893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2662  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0870551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0886  Integrase catalytic region  28.65 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  29.01 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  29.01 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  29.01 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_31  putative phage intergrase  26.6 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  29.01 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  29.01 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  26.39 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6543  hypothetical protein  23.53 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0252  putative bacteriophage DNA transposition protein A  36.36 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6453  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0646  Integrase catalytic region  24.7 
 
 		 724 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5417  integrase catalytic subunit  28.1 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.751819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  29.45 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5591  integrase catalytic subunit  28.1 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3847  Integrase catalytic region  25.69 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3099  helix-turn-helix, Fis-type  26.86 
 
 		 479 aa  57  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1541  helix-turn-helix, Fis-type  26.29 
 
 		 495 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4906  integrase catalytic subunit  28.33 
 
 		 205 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.350856 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5077  integrase catalytic subunit  28.33 
 
 		 266 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>