53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1537 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 1672 aa  3426    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  52.49 
 
 		 1687 aa  1785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2288  hypothetical protein  35.71 
 
 		 542 aa  159  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2948  hypothetical protein  46.6 
 
 		 861 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.0000000754112  unclonable  0.0000101752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5788  transglutaminase domain protein  25.07 
 
 		 2543 aa  93.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1625 aa  87  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2947  hypothetical protein  32.85 
 
 		 356 aa  76.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000155126  hitchhiker  0.00244258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 		 1760 aa  75.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2613  hypothetical protein  24.85 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  24.71 
 
 		 636 aa  69.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 		 1711 aa  63.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.92 
 
 		 1686 aa  60.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.08 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2990  putative ATPase  30.56 
 
 		 1406 aa  59.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.12243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4183  ATP-binding region ATPase domain protein  19.3 
 
 		 1084 aa  58.9  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.843954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  22.98 
 
 		 903 aa  57  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  23.29 
 
 		 900 aa  57.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  22.62 
 
 		 781 aa  56.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0197  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1414 aa  56.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.45 
 
 		 729 aa  55.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1073  HATPase_c domain-containing protein  30.46 
 
 		 807 aa  54.7  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4727  hypothetical protein  25 
 
 		 1012 aa  54.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  21.15 
 
 		 654 aa  54.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 		 316 aa  54.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07280  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 		 1882 aa  53.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.955647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.22 
 
 		 1004 aa  52.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3292  hypothetical protein  23.94 
 
 		 985 aa  52.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  33.04 
 
 		 1584 aa  52.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5338  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1934 aa  51.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 160 aa  51.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.69 
 
 		 466 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  20.93 
 
 		 890 aa  51.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  21.54 
 
 		 731 aa  50.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0731  hypothetical protein  22.5 
 
 		 583 aa  50.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.18 
 
 		 795 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  22.7 
 
 		 241 aa  50.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  22.39 
 
 		 871 aa  49.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.18 
 
 		 795 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.55 
 
 		 261 aa  49.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1097 aa  49.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.74 
 
 		 322 aa  48.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 230 aa  48.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 225 aa  48.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 223 aa  48.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4088  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.63 
 
 		 667 aa  47.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.644971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3709  hypothetical protein  18.88 
 
 		 1306 aa  47.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  25.84 
 
 		 671 aa  47.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 208 aa  46.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  23.49 
 
 		 199 aa  46.6  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.94 
 
 		 590 aa  45.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  20.33 
 
 		 898 aa  45.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>