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for query gene Dshi_0717 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0717  multidrug resistance protein  100 
 
 		 408 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.29522  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_3375  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.49 
 
 		 405 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0699824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2307  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.7 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.31 
 
 		 401 aa  438  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0859  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.36 
 
 		 406 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2187  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  58.96 
 
 		 406 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1878  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  57 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.998766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4471  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.4 
 
 		 402 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.07 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.09 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5788  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.47 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.47 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4516  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.47 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3946  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501958  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4409  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 403 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4139  major facilitator transporter  45.11 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.956348  normal  0.0272959 
 
 
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NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.99 
 
 		 429 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
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NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.7 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
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NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.41 
 
 		 430 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6161  Bcr/CflA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245445  normal  0.0414342 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.92 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.71 
 
 		 428 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  32.98 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.02 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.69 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.56 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.64 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  32.46 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
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NC_003912  CJE0034  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.18 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.276652  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3647  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.92 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.289957 
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0073  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.91 
 
 		 403 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0540889  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.27 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
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NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  33.24 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  31.98 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.19 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.19 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.5 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
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NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.64 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.94 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.19 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.85 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.17 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.48 
 
 		 418 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.04 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.69 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.61 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2482  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.08 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245428  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.95 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.08 
 
 		 401 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.02 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.32 
 
 		 405 aa  139  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.51 
 
 		 435 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  30.06 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.64 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.25 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3135  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.23 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.95279 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.49 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.95 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.08 
 
 		 461 aa  136  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.2 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.05 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  29.18 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.61 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.61 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.98 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  35.83 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.61 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.49 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2059  putative transporter protein  32.36 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.79 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.08 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
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NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.37 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.97 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.09 
 
 		 440 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.13 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.61 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.36 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.36 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3110  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0683  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.36 
 
 		 403 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.86 
 
 		 411 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.18 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.97 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.97 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.75 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_01631  predicted transporter  28.47 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1740  inner membrane transport protein YdhC  28.47 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.41176e-17  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_01620  hypothetical protein  28.47 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.05 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1874  inner membrane transport protein YdhC  28.47 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136238  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.93 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
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NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.02 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
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