More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0700 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  45.56 
 
 		 273 aa  244  8e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  45.8 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  38.4 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  46.86 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  46.39 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  46.73 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  40.21 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  41.49 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  40.21 
 
 		 245 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  39.66 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  39.11 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  39.66 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  39.49 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  34.6 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  36.6 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  35.19 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  38.78 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  35.2 
 
 		 434 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  36.7 
 
 		 247 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  36.17 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  35.64 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  37.63 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  37.37 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  33.68 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  38.04 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  42.55 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  42.68 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  43.55 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  43.55 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  31.03 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  39.66 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  34.38 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  34.07 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  34.09 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  34.09 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  34.09 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  34.09 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  29.03 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  32.95 
 
 		 391 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  40.85 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  45.16 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.45 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  29.52 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.23 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  40.28 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  41.67 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  40.98 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  40.96 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  30.77 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  35.63 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  38.98 
 
 		 79 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  36.99 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  35.21 
 
 		 438 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  35.21 
 
 		 408 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  38.03 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  36.21 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  42.42 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 347 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  41.27 
 
 		 430 aa  52.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  45 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 241 aa  52.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  40.35 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  37.18 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  31.82 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  30.19 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  40.74 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  36.78 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  38.46 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  50 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  34.19 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  38.98 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  46.94 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  34.44 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  30.23 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  47.5 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  31.37 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  36.25 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  46.94 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  36.51 
 
 		 517 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  52.63 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0919  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3453  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.837221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0885  Ion transport 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0909  Ion transport 2 domain protein  31.82 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0497907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  34.57 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>