27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0707 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  501  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  45.71 
 
 
246 aa  248  8e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  45.71 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  45.31 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  46.06 
 
 
248 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  44 
 
 
248 aa  224  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  43.1 
 
 
247 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  38.27 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  37.86 
 
 
245 aa  194  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  37.45 
 
 
245 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  41.38 
 
 
252 aa  192  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  36.51 
 
 
246 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  41.67 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  38.46 
 
 
257 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  45.26 
 
 
273 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  36.78 
 
 
250 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  36.78 
 
 
434 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  37.45 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  35.04 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  35.54 
 
 
250 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  38.89 
 
 
245 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  35.12 
 
 
250 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  39.91 
 
 
247 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  36.6 
 
 
274 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  33.18 
 
 
251 aa  152  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  39.78 
 
 
276 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>