27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_20 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  895    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  97.2 
 
 		 250 aa  500  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  88.4 
 
 		 250 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  39.33 
 
 		 246 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  39 
 
 		 246 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  40.52 
 
 		 252 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  39.83 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  38.78 
 
 		 246 aa  193  6e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  41.28 
 
 		 252 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  37.23 
 
 		 247 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  36.78 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  38.6 
 
 		 245 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  37.83 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  39.18 
 
 		 248 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  35.15 
 
 		 248 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  37.39 
 
 		 245 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  40.61 
 
 		 247 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  36.78 
 
 		 250 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  35.95 
 
 		 250 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  37.22 
 
 		 257 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  32.66 
 
 		 249 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  37.44 
 
 		 273 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  33.04 
 
 		 245 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  35.2 
 
 		 274 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  31.49 
 
 		 251 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  37.77 
 
 		 276 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>