27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0020 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  90 
 
 
250 aa  465  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  88.4 
 
 
434 aa  457  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  43.28 
 
 
247 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  39.92 
 
 
246 aa  208  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  39.58 
 
 
252 aa  195  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  39.75 
 
 
246 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  39.26 
 
 
246 aa  188  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  37.6 
 
 
246 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  38.52 
 
 
247 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  40.17 
 
 
252 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  37.45 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  38.84 
 
 
248 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  39.48 
 
 
245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  38.72 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  39.66 
 
 
245 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  36.1 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  39 
 
 
247 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  38.18 
 
 
257 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  37.19 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  35.22 
 
 
245 aa  151  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  37.25 
 
 
273 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  30.74 
 
 
251 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  35.64 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  35.03 
 
 
276 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>