27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1577 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  46.38 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  44.64 
 
 
246 aa  207  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  45.06 
 
 
246 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  44.21 
 
 
246 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  42.32 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  38.46 
 
 
247 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  42.08 
 
 
248 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  39.33 
 
 
246 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  38.36 
 
 
247 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  36.29 
 
 
250 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  36.91 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  35.42 
 
 
434 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  41.23 
 
 
245 aa  161  7e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  37.33 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  38.77 
 
 
245 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  38.84 
 
 
245 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  35.06 
 
 
250 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  36.05 
 
 
251 aa  155  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  34.63 
 
 
250 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  39.15 
 
 
273 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  35.87 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  35.56 
 
 
252 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  37.72 
 
 
247 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  37.37 
 
 
274 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  29.79 
 
 
249 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  29.85 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>