27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2469 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  58.3 
 
 
252 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  57.26 
 
 
247 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  53.02 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  47.01 
 
 
248 aa  198  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  45.41 
 
 
246 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  41.03 
 
 
250 aa  192  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  41.28 
 
 
434 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  41.67 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  43.53 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  39.58 
 
 
245 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  41.38 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  40.09 
 
 
246 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  39.58 
 
 
245 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  38.96 
 
 
247 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  42.23 
 
 
250 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  39.65 
 
 
246 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  46.73 
 
 
274 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  38.77 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  38.49 
 
 
248 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  39.66 
 
 
245 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  36.24 
 
 
249 aa  151  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  39.09 
 
 
276 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  35.29 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  32.17 
 
 
250 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  31.74 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  31.8 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>