27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3261 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3261  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1460  hypothetical protein  59.92 
 
 		 247 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0386227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2469  hypothetical protein  53.02 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2371  hypothetical protein  47.48 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1218  hypothetical protein  41.99 
 
 		 245 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.982623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0566  hypothetical protein  45.61 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00270463  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2030  hypothetical protein  45.8 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1462  hypothetical protein  41.13 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0737  hypothetical protein  40.26 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.542586  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1592  hypothetical protein  41.48 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.961862  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1083  hypothetical protein  41.48 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0863  hypothetical protein  41.48 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_20  hypothetical protein  40.61 
 
 		 434 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00632625  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0021  hypothetical protein  38.98 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  42.06 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  42.18 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0707  hypothetical protein  39.57 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0020  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2165  hypothetical protein  39.91 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0643  hypothetical protein  41.26 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0788162  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0870  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00543132  normal  0.0127443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0043  hypothetical protein  40.42 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00659965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00740931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1577  hypothetical protein  37.05 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  35.37 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0206  hypothetical protein  29.49 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>