269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0644 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0644  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  776    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.535291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1014  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1033  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.177021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0605  hypothetical protein  28.46 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1626  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0561  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1835  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  27.65 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  33.53 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  28.28 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  27.58 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  26.91 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  33.33 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  32.24 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  32.24 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.2 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2304  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  25.9 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  21.1 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  25.92 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  28.12 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  25.36 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  28.12 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  28.12 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  28.12 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  24.93 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  28.57 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  27.34 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.85 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  25.91 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  25.7 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  27.07 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  27.07 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  25.7 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  25.7 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  24.94 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  24.5 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  25.7 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  27.82 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  25.42 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  35 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  27.82 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  24.5 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  24.68 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1315  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  25.17 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  25.17 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.26 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  24.68 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  24.68 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  28.49 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  30.37 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.54 
 
 		 388 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.54 
 
 		 388 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  24.76 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>