More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2616 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
527 aa  1078    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.83 
 
 
526 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 
546 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
532 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
523 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
526 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
551 aa  365  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.09 
 
 
461 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 
523 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
582 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
579 aa  239  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.1 
 
 
585 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.88 
 
 
530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
567 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 
525 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
543 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
536 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.42 
 
 
554 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
582 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
516 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 
534 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
603 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.98 
 
 
591 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
582 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
546 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  30.76 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
543 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.93 
 
 
557 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
574 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
559 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
582 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
536 aa  213  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
560 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
579 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  32.43 
 
 
559 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
564 aa  209  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
545 aa  209  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
519 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
576 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
524 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
584 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
554 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 
574 aa  206  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
579 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 
557 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
552 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
519 aa  205  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
578 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
568 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.47 
 
 
525 aa  205  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
577 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
600 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
528 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
583 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
579 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
579 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  32.01 
 
 
585 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
529 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.18 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.65 
 
 
551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 
557 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 
573 aa  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
559 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
557 aa  200  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
543 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
581 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
559 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
532 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 
567 aa  196  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
522 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
532 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.7 
 
 
567 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  33.62 
 
 
560 aa  193  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
537 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
537 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
585 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
575 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
573 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.62 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
573 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
560 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.99 
 
 
522 aa  190  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.33 
 
 
560 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.33 
 
 
560 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
560 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.62 
 
 
560 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.62 
 
 
560 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.62 
 
 
560 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.62 
 
 
560 aa  190  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
572 aa  190  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
531 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  32.26 
 
 
517 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>