More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2106 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 573 aa  1162    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.13 
 
 		 578 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.79 
 
 		 574 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.67 
 
 		 573 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  42.43 
 
 		 578 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.5 
 
 		 568 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.98 
 
 		 569 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.94 
 
 		 599 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.22 
 
 		 572 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 885 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.19 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.48 
 
 		 907 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.23 
 
 		 573 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.41 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.23 
 
 		 573 aa  353  7e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  36.72 
 
 		 566 aa  353  7e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.05 
 
 		 564 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  36.25 
 
 		 568 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  40.23 
 
 		 592 aa  351  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  34.95 
 
 		 574 aa  350  4e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40 
 
 		 579 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.8 
 
 		 572 aa  346  8.999999999999999e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.64 
 
 		 564 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.55 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.86 
 
 		 814 aa  339  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.1 
 
 		 584 aa  339  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.22 
 
 		 570 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.8 
 
 		 568 aa  333  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.92 
 
 		 587 aa  332  9e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.9 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  38.78 
 
 		 932 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.77 
 
 		 811 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 827 aa  326  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.56 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.74 
 
 		 573 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.97 
 
 		 573 aa  322  8e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.5 
 
 		 732 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.5 
 
 		 801 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.12 
 
 		 572 aa  320  6e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.07 
 
 		 831 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.38 
 
 		 785 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 583 aa  317  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  34.34 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.5 
 
 		 989 aa  315  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.62 
 
 		 584 aa  314  2.9999999999999996e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.88 
 
 		 570 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.88 
 
 		 977 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.1 
 
 		 571 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  34.81 
 
 		 566 aa  313  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.47 
 
 		 574 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.05 
 
 		 798 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.34 
 
 		 788 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.86 
 
 		 773 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.63 
 
 		 779 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.3 
 
 		 857 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.48 
 
 		 911 aa  306  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.48 
 
 		 567 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.87 
 
 		 779 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.87 
 
 		 779 aa  306  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.58 
 
 		 577 aa  306  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.45 
 
 		 779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.1 
 
 		 566 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  34.13 
 
 		 584 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 779 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.69 
 
 		 779 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.69 
 
 		 779 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 779 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.87 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1279  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.69 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1308  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.69 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  33.57 
 
 		 779 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.57 
 
 		 779 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.9 
 
 		 569 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.1 
 
 		 865 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.9 
 
 		 569 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.78 
 
 		 571 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.34 
 
 		 955 aa  300  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  39.88 
 
 		 571 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.9 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.81 
 
 		 574 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  39.41 
 
 		 569 aa  298  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.38 
 
 		 574 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.35 
 
 		 955 aa  297  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.38 
 
 		 574 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.7 
 
 		 574 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  36.7 
 
 		 577 aa  297  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.9 
 
 		 569 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.7 
 
 		 1102 aa  296  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
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NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.9 
 
 		 564 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.9 
 
 		 564 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.9 
 
 		 564 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.9 
 
 		 564 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.9 
 
 		 564 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.9 
 
 		 564 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.43 
 
 		 1035 aa  296  7e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  34.59 
 
 		 577 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.12 
 
 		 584 aa  296  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.9 
 
 		 564 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  35.56 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
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NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.62 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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