268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4463 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4463  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 285 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1128  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase/reductase  25.45 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1426  hypothetical protein  27.4 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0301389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0242314  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.35 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0139899  normal  0.0320984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  23.11 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.24 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.02 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0360339 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.51 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0877  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.753943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  23.65 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  22.92 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0418863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.68 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.91 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  24.51 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.37 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0694  NAD dependent epimerase/dehydratase family  25 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  22.68 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0633  epimerase protein  20.43 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.42 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07621  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.02 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.53 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.182648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000873024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4601  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.68 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.53 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0659  UDP-glucose 4-epimerase  24.91 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  25.79 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10430  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.63 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.4 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  26.1 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0963  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  25.58 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.01 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.48 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 		 664 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.71 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  25.96 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.99 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.388725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6244  oxidoreductase Rmd  21.93 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.56 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.58 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  23.26 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  24.89 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.2 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0596  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.67 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.483885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.25 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  25.63 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 335 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.12 
 
 		 341 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0430992  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.72 
 
 		 332 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72000  oxidoreductase Rmd  22.68 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  29.26 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  24.32 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1800  oxidoreductase Rmd  23.27 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0661573 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.28 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 		 343 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  21.41 
 
 		 337 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.7 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  19.93 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1848  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  25.32 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.66 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.11 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  22.19 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>