More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3746 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
135 aa  278  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.15 
 
 
134 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.6 
 
 
160 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.4 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  38.58 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.15 
 
 
183 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.13 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.13 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.29 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  36.89 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.84 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 
234 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.562709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0400  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.16 
 
 
216 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0468  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.62 
 
 
216 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0616317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0669  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  35.34 
 
 
417 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.52 
 
 
247 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.97 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.51 
 
 
531 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000747261  hitchhiker  0.000000428975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  36.13 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
180 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  33.88 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5950  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.34 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240126  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4383  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.5 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.77 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.07 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
180 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  31.62 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  35.34 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  36.64 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  35.71 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.72 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  36.29 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  37.19 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.79 
 
 
254 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  39.13 
 
 
183 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  34.92 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  35.83 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  35 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  37.1 
 
 
215 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  35.83 
 
 
182 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  80.1  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  33.83 
 
 
180 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35 
 
 
171 aa  80.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0702  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.71 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.45 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  33.08 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  38.61 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  34.31 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  33.08 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.39 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.61 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  33.08 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  33.83 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  37.19 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  32.31 
 
 
176 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  33.06 
 
 
273 aa  79  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  34.68 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  34.45 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  34.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  31.67 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  32.82 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  34.51 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  32.23 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  30.16 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  38.61 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  38.61 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  34.65 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  35.66 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  30.58 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  34.23 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  34.17 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2714  hydrogenase 4 subunit H  37.37 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.594807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  30.58 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0812  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.28 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  32.85 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  37.29 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  32.85 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  34.68 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>