More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0155 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  61.79 
 
 
283 aa  351  8.999999999999999e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  58.57 
 
 
281 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  57.97 
 
 
283 aa  334  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  57.3 
 
 
282 aa  331  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  57.65 
 
 
281 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  56.94 
 
 
281 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 
282 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  53.38 
 
 
282 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  56.79 
 
 
280 aa  308  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  57.14 
 
 
281 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  56.79 
 
 
280 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  56.36 
 
 
288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  53.57 
 
 
300 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  54.48 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
283 aa  299  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 
279 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 
282 aa  297  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 
282 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 
282 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 
282 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
282 aa  295  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
282 aa  295  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 
282 aa  294  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
282 aa  293  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
284 aa  292  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  51.61 
 
 
282 aa  291  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  50.9 
 
 
282 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  52.33 
 
 
300 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  52.31 
 
 
281 aa  289  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 
283 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  53.85 
 
 
277 aa  286  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  52.5 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
309 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  53.85 
 
 
280 aa  285  8e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  53.11 
 
 
277 aa  285  8e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  51.6 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  52.63 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  50.74 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 
278 aa  281  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  52.14 
 
 
281 aa  281  6.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  50.72 
 
 
282 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  52.51 
 
 
278 aa  281  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 
286 aa  281  9e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
291 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  53.85 
 
 
283 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
293 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
293 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  54.26 
 
 
277 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  50.19 
 
 
276 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  51.26 
 
 
327 aa  276  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
283 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  48.57 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  45.74 
 
 
282 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  54.69 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  50.76 
 
 
273 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  52.54 
 
 
279 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  48.95 
 
 
289 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
281 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
284 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.68 
 
 
282 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2942  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  47.84 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  50.19 
 
 
539 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  49.11 
 
 
281 aa  265  8.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  47.65 
 
 
288 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  48.38 
 
 
282 aa  262  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  47.16 
 
 
283 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  49.64 
 
 
283 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.67 
 
 
529 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.48 
 
 
534 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 
287 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 
283 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.58 
 
 
285 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  49.12 
 
 
287 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
286 aa  255  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3175  pantoate--beta-alanine ligase  47.84 
 
 
281 aa  254  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
287 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  49.3 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 
283 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.25 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 
281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 
283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.58 
 
 
289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  48.25 
 
 
283 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  48.25 
 
 
283 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  48.25 
 
 
283 aa  251  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 
283 aa  250  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0869  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
281 aa  250  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>