More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0035 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0035  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 546 aa  1124    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000195087  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1465  extracellular solute-binding protein family 5  49.5 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0187  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  46.3 
 
 		 542 aa  488  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  40.07 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1345  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  42.86 
 
 		 552 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.932628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1271  extracellular solute-binding protein family 5  41.56 
 
 		 533 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000259985  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  39.27 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3066  extracellular solute-binding protein family 5  39.57 
 
 		 547 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0011  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 		 534 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0146567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1329  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  38.42 
 
 		 532 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0216  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 		 569 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2550  extracellular solute-binding protein family 5  39.38 
 
 		 523 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00133049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0331  extracellular solute-binding protein family 5  36.18 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557928  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1125  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 525 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0107082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1071  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  37.1 
 
 		 525 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0509495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3547  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  36.9 
 
 		 515 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000727174  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1345  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  35.54 
 
 		 544 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.38578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1925  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  35.34 
 
 		 544 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176538  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1376  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  35.34 
 
 		 544 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.268389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1361  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  35.14 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0151112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2106  nickel ABC transporter periplasmic nickel-binding protein  34.94 
 
 		 544 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3644  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1675  oligopeptide-binding protein OppA  34.27 
 
 		 512 aa  286  9e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  29.12 
 
 		 519 aa  187  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 526 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  29.01 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.84 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04010  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.15 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.115797  normal  0.0514058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.9 
 
 		 557 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1971  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 		 525 aa  143  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.743088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4500  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0119  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 532 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.135782 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.11 
 
 		 511 aa  137  7.000000000000001e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 508 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.64 
 
 		 511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  24.19 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 619 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.28 
 
 		 622 aa  123  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  23.81 
 
 		 540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  25.41 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  25.41 
 
 		 579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  23.94 
 
 		 576 aa  120  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.4 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 575 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  24.25 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  23.23 
 
 		 517 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 515 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.53 
 
 		 511 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 555 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.09 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  24.81 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  24.76 
 
 		 575 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 526 aa  114  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.86 
 
 		 575 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.86 
 
 		 511 aa  114  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 503 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 565 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 503 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.05 
 
 		 575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 512 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 512 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 512 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.8 
 
 		 524 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.82 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 540 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  23.43 
 
 		 534 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  24.82 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 575 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.57 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 575 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.7 
 
 		 516 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 522 aa  107  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  26.08 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 567 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0041  hypothetical protein  25.62 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.561625  normal  0.893455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  23.91 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 545 aa  105  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 512 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  24.24 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.88 
 
 		 516 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  24.22 
 
 		 516 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  22.69 
 
 		 557 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  24.22 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 516 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>