More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1832 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1832  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
623 aa  1236    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2075  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.5 
 
 
621 aa  774    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000894512  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  50.77 
 
 
614 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.68 
 
 
611 aa  571  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.75 
 
 
612 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  51.57 
 
 
641 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.77 
 
 
637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.77 
 
 
650 aa  559  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  50.79 
 
 
660 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.26 
 
 
608 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 
645 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.09 
 
 
615 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.76 
 
 
643 aa  561  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  49.17 
 
 
644 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.17 
 
 
647 aa  557  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.61 
 
 
621 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
663 aa  558  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  50.61 
 
 
658 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  49.17 
 
 
647 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
648 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 
643 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  49.17 
 
 
644 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  49.34 
 
 
643 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  51.22 
 
 
659 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  50 
 
 
681 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 
612 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  49.17 
 
 
644 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  51.66 
 
 
639 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  48.84 
 
 
647 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  49.17 
 
 
647 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  49.34 
 
 
644 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  49 
 
 
647 aa  554  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  50.42 
 
 
627 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.85 
 
 
657 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  53.44 
 
 
651 aa  555  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.85 
 
 
657 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  48.59 
 
 
647 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.85 
 
 
652 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49 
 
 
650 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  48.59 
 
 
644 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.85 
 
 
657 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.85 
 
 
657 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  55.62 
 
 
650 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  48.34 
 
 
647 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  55.24 
 
 
649 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  48.34 
 
 
647 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  48.34 
 
 
647 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.62 
 
 
657 aa  551  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  51.77 
 
 
616 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.53 
 
 
655 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  48.45 
 
 
660 aa  549  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  48.67 
 
 
644 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0429  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.73 
 
 
626 aa  551  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0157524  hitchhiker  0.00156876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 
638 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.24 
 
 
657 aa  551  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  48.42 
 
 
647 aa  551  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.26 
 
 
640 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  48.34 
 
 
647 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.31 
 
 
649 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  48.5 
 
 
647 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.09 
 
 
650 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.93 
 
 
651 aa  551  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  49.47 
 
 
612 aa  549  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.6 
 
 
651 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.24 
 
 
657 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.24 
 
 
657 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
621 aa  546  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.6 
 
 
642 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  49.3 
 
 
638 aa  548  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 
660 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  50.43 
 
 
649 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.19 
 
 
656 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
654 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.24 
 
 
656 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.92 
 
 
621 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  50.27 
 
 
641 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.22 
 
 
635 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.02 
 
 
656 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.66 
 
 
637 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  50.26 
 
 
644 aa  545  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.53 
 
 
655 aa  545  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 
640 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.09 
 
 
639 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0210  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.61 
 
 
626 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 
676 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.78 
 
 
640 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  49.48 
 
 
649 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  51.6 
 
 
637 aa  545  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.91 
 
 
602 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.35 
 
 
645 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.51 
 
 
632 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 
657 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.09 
 
 
639 aa  545  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.42 
 
 
643 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.09 
 
 
640 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.43 
 
 
642 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  48.42 
 
 
611 aa  540  9.999999999999999e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.77 
 
 
639 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.4 
 
 
610 aa  541  9.999999999999999e-153  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.74 
 
 
630 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>