More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1733 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 161 aa  327  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2438  3-dehydroquinate dehydratase type II  65 
 
 		 146 aa  174  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0996759  normal  0.483602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2471  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.14 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  59.71 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 146 aa  168  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.97 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.1 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  50.7 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6532  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.59 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  54.01 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  52.29 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 145 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 147 aa  150  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 147 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0610  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 148 aa  148  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 149 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  51.45 
 
 		 145 aa  147  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0381  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  52.63 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 142 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 193 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 193 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 193 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1702  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 145 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.345315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 		 176 aa  143  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  53.28 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  53.28 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  51.35 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1333  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.736952  normal  0.590383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.24 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  52.55 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>