More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4033 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 699 aa  1427    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  49.11 
 
 		 734 aa  678    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  44.37 
 
 		 722 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  43.74 
 
 		 713 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  42.03 
 
 		 712 aa  568  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  42.4 
 
 		 721 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 		 719 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  40.09 
 
 		 715 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 		 719 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 		 724 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  37.54 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 		 798 aa  343  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  34.64 
 
 		 747 aa  330  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.38 
 
 		 335 aa  98.6  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4014  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 337 aa  91.3  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 360 aa  87.4  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 360 aa  87.4  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.47 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.84 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  25.16 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  25.16 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.1 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  30.24 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  28.08 
 
 		 340 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  28.63 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  27.76 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.9 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  24.76 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.95 
 
 		 360 aa  80.1  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.55 
 
 		 354 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  31.88 
 
 		 341 aa  79.7  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  28.06 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  27.94 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.39 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.74 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 340 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 327 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  28.34 
 
 		 360 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  27.04 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.62 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 		 349 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.28 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  24.6 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.05 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  31.44 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  26.86 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 350 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.3 
 
 		 369 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  30.17 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 374 aa  73.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.77 
 
 		 353 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.21 
 
 		 341 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  24.18 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 350 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 362 aa  72  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.78 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 375 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 345 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.61 
 
 		 373 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  30.56 
 
 		 347 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 667 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 		 329 aa  70.5  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 344 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  27.02 
 
 		 342 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.16 
 
 		 349 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.61 
 
 		 359 aa  70.1  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03333  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 790 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.552824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.51 
 
 		 322 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 360 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 		 333 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  28.5 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>