200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2198 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  100 
 
 		 445 aa  922    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  67.27 
 
 		 445 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  48.22 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  48.46 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  48.46 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  48.46 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  48.46 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  47.81 
 
 		 460 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  48.46 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  51.5 
 
 		 462 aa  418  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  48.03 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  51.61 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  51.36 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  42.32 
 
 		 416 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  42.32 
 
 		 416 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  42.32 
 
 		 416 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  42.32 
 
 		 414 aa  326  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  42.07 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  41.75 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  40.75 
 
 		 413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  40.7 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  41 
 
 		 413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  36.43 
 
 		 421 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  36.68 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  36.18 
 
 		 414 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  36.18 
 
 		 421 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  36.43 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  35.07 
 
 		 403 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  32.77 
 
 		 405 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  34.27 
 
 		 405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  31.75 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  31.9 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.7 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.29 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  33.02 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  33.02 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  34.06 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  30.5 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  32.3 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  29.34 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  32.3 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  30.68 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  29.87 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  32.68 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  31.4 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  29.11 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.11 
 
 		 395 aa  156  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.78 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  32.92 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.77 
 
 		 399 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.87 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  30.08 
 
 		 398 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  28.23 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  29.81 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  27.73 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.75 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  27.88 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  29.27 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  29.27 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  28.99 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  25.63 
 
 		 412 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.3 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.44 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  27.85 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  24.88 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.39 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.44 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  26.79 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  25.13 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  25.13 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  25.13 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  25.13 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  25.13 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  25.13 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.01 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  28.49 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  24.87 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  24.81 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.27 
 
 		 424 aa  113  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  27.23 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  27.41 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  28.04 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  27.59 
 
 		 432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  24.93 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  26.36 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  26.97 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.87 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.81 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  27.39 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  26.68 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.23 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  27.59 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  27.32 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  27.23 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.67 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  26.41 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  27.2 
 
 		 422 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.32 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.19 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>